Steamコントローラの設定がゲーム内で機能しない場合は、選択した入力方式にそのゲームが対応していない可能性があります。そのゲームのコミュニティ設定から動作するものがあるか探してみてください。

ゲームパッド専用の入力方式は、ゲームパッドに対応しているゲームでのみ機能します。
DOTA 2のようなゲームパッドに対応していないゲームをプレイする場合は、「ジョイスティック移動」、「ジョイスティックカメラ」などのゲームパッド専用の入力方式を使って移動したり周りを見たりすることができません。

フレキシブル入力方式のコマンドは、ゲームの制限に対応しなければなりません。
「十字キー」や「ボタンパッド」などのフレキシブル入力形式は、ユーザーにキーボードやマウス、ゲームパッドのコマンドをボタンに割り当てる選択肢を与えてくれます。 YまたはXボタンのようなゲームパッド特有のコマンドを選べば、ゲームパッド対応しているゲームのみで正常に機能します。